MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halanaerobium praevalens DSM 2228 chromosome

Total Repeats: 8329

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017455	CAA	2	6	5	10	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017455	CTTGT	2	10	83	92	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017455	CTTTT	2	10	103	112	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017455	T	7	7	109	115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017455	T	7	7	124	130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017455	A	7	7	145	151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017455	T	6	6	251	256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017455	T	7	7	282	288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017455	AGG	2	6	297	302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017455	T	8	8	1725	1732	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017455	TAAT	2	8	1740	1747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017455	CAA	2	6	1748	1753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017455	TAA	2	6	1783	1788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017455	AAC	2	6	1842	1847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017455	ACT	2	6	1874	1879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017455	CTA	6	18	1911	1928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017455	AT	3	6	1938	1943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017455	TAA	2	6	1973	1978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017455	TAA	2	6	3160	3165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017455	AAT	2	6	3174	3179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017455	AGG	2	6	3194	3199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017455	TAAAAA	2	12	9373	9384	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017455	T	6	6	9442	9447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017455	A	7	7	9466	9472	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017455	T	6	6	9481	9486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017455	ATA	3	9	9501	9509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017455	ATT	2	6	9510	9515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017455	TATAA	2	10	9522	9531	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017455	TAA	2	6	9540	9545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017455	TAA	2	6	9558	9563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017455	ATT	2	6	9578	9583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017455	A	6	6	9665	9670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017455	TAAT	2	8	9687	9694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017455	A	6	6	9709	9714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017455	A	7	7	9719	9725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017455	TAG	2	6	9753	9758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017455	GATA	2	8	9768	9775	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017455	T	8	8	9790	9797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017455	TGT	2	6	9843	9848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017455	ATA	2	6	9855	9860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017455	TGATA	2	10	9924	9933	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017455	AAT	2	6	9948	9953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017455	AGTTT	2	10	9967	9976	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017455	GAA	2	6	9986	9991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017455	T	6	6	9997	10002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017455	TCT	2	6	10019	10024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017455	TA	4	8	10026	10033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017455	A	6	6	10061	10066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017455	AGTG	2	8	10112	10119	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017455	A	6	6	10150	10155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017455	TAA	2	6	10198	10203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017455	TAA	2	6	10229	10234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017455	ATT	2	6	10310	10315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017455	ATA	2	6	10337	10342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017455	CAAATT	2	12	10348	10359	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017455	GGC	2	6	10400	10405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017455	AAT	2	6	10501	10506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017455	CA	3	6	10574	10579	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017455	GAG	3	9	10608	10616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017455	TAGC	2	8	10629	10636	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017455	CAA	2	6	10661	10666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017455	GCA	2	6	10735	10740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017455	CGC	2	6	10782	10787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_017455	TGAA	2	8	10789	10796	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017455	GAA	2	6	10831	10836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017455	GGA	2	6	10877	10882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017455	CAG	2	6	10903	10908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017455	ATT	2	6	10944	10949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017455	TCAAG	2	10	10977	10986	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017455	TAGTG	2	10	11065	11074	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017455	GAA	2	6	11095	11100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017455	CT	3	6	11119	11124	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017455	GAA	2	6	11357	11362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017455	GGT	2	6	11434	11439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017455	GTC	2	6	11448	11453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017455	TCGTG	2	10	11457	11466	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_017455	AAG	2	6	11539	11544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017455	GGA	2	6	11561	11566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017455	AC	3	6	11612	11617	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017455	AATC	2	8	11676	11683	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017455	AC	3	6	11781	11786	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017455	CCT	2	6	11906	11911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_017455	GA	3	6	11919	11924	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017455	CTTT	2	8	11963	11970	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017455	GAATA	2	10	12017	12026	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017455	TATT	2	8	12055	12062	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017455	A	6	6	12064	12069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017455	AGT	2	6	12125	12130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017455	CCA	2	6	12147	12152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_017455	TTAA	2	8	12172	12179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017455	GCCT	2	8	12215	12222	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017455	AGG	2	6	12230	12235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017455	CCA	2	6	12260	12265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_017455	TTA	2	6	12267	12272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017455	T	6	6	12278	12283	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017455	TTTAA	2	10	12288	12297	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017455	ACT	2	6	12343	12348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017455	TTGAA	2	10	12376	12385	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017455	GATT	2	8	12436	12443	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017455	TGG	2	6	12461	12466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017455	TGA	2	6	12486	12491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017455	GCT	2	6	12524	12529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017455	CCA	2	6	12568	12573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_017455	TAT	2	6	12588	12593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017455	TA	3	6	12611	12616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017455	TAG	2	6	12682	12687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017455	GCGA	2	8	12690	12697	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017455	T	6	6	12797	12802	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017455	AAG	2	6	12834	12839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017455	AAG	2	6	12866	12871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017455	ACC	2	6	12929	12934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_017455	ACA	2	6	13042	13047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017455	AGG	2	6	13051	13056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017455	CAA	2	6	13407	13412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017455	ACC	2	6	13510	13515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_017455	AGC	2	6	13590	13595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017455	TTATAT	2	12	13694	13705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017455	AGA	2	6	13773	13778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017455	GA	3	6	13777	13782	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017455	A	6	6	13801	13806	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017455	TCC	2	6	13859	13864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_017455	AG	3	6	13972	13977	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017455	GAA	2	6	13993	13998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017455	AGG	2	6	14025	14030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017455	GC	3	6	14177	14182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017455	GA	3	6	14183	14188	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017455	CATTAG	2	12	14244	14255	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_017455	CGG	2	6	14418	14423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017455	CAA	2	6	14512	14517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017455	TGG	2	6	14679	14684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017455	ACC	2	6	14688	14693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_017455	AGAC	2	8	14868	14875	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017455	CGG	2	6	14911	14916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017455	CGT	2	6	15107	15112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017455	AC	3	6	15191	15196	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017455	GTT	2	6	15210	15215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017455	CCA	2	6	15216	15221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_017455	AAG	2	6	15314	15319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017455	GAT	2	6	15335	15340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017455	GTA	2	6	15367	15372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017455	ATT	2	6	15415	15420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017455	ATACA	2	10	15453	15462	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_017455	GGT	2	6	15478	15483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017455	TCC	2	6	15532	15537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_017455	T	7	7	15593	15599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017455	A	6	6	15613	15618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017455	ATA	2	6	15625	15630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017455	TATAG	2	10	15665	15674	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017455	A	6	6	15676	15681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_017455	TTA	2	6	15970	15975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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188	NC_017455	A	7	7	25905	25911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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